Protein–RNA interactions for Protein: P53618

COPB1, Coatomer subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB1P53618 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COPB1P53618 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COPB1P53618 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COPB1P53618 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COPB1P53618 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COPB1P53618 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
COPB1P53618 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COPB1P53618 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COPB1P53618 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COPB1P53618 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COPB1P53618 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COPB1P53618 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COPB1P53618 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COPB1P53618 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
COPB1P53618 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
COPB1P53618 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
COPB1P53618 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
COPB1P53618 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
COPB1P53618 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COPB1P53618 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
COPB1P53618 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
COPB1P53618 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COPB1P53618 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COPB1P53618 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COPB1P53618 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COPB1P53618 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COPB1P53618 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPB1P53618 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPB1P53618 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPB1P53618 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPB1P53618 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPB1P53618 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPB1P53618 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPB1P53618 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPB1P53618 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPB1P53618 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPB1P53618 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COPB1P53618 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COPB1P53618 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COPB1P53618 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COPB1P53618 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COPB1P53618 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COPB1P53618 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COPB1P53618 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COPB1P53618 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COPB1P53618 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COPB1P53618 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COPB1P53618 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COPB1P53618 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COPB1P53618 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPB1P53618 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPB1P53618 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPB1P53618 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPB1P53618 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPB1P53618 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPB1P53618 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPB1P53618 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPB1P53618 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPB1P53618 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPB1P53618 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COPB1P53618 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COPB1P53618 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COPB1P53618 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COPB1P53618 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COPB1P53618 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COPB1P53618 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COPB1P53618 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COPB1P53618 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COPB1P53618 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
COPB1P53618 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COPB1P53618 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COPB1P53618 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPB1P53618 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPB1P53618 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPB1P53618 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPB1P53618 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPB1P53618 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPB1P53618 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPB1P53618 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPB1P53618 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPB1P53618 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPB1P53618 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPB1P53618 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPB1P53618 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPB1P53618 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPB1P53618 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPB1P53618 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPB1P53618 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPB1P53618 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COPB1P53618 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
COPB1P53618 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
COPB1P53618 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
COPB1P53618 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
COPB1P53618 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
COPB1P53618 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
COPB1P53618 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COPB1P53618 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COPB1P53618 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COPB1P53618 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COPB1P53618 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 228.3 ms