Protein–RNA interactions for Protein: O95447

LCA5L, Lebercilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5LO95447 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LCA5LO95447 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LCA5LO95447 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LCA5LO95447 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LCA5LO95447 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LCA5LO95447 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LCA5LO95447 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LCA5LO95447 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LCA5LO95447 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LCA5LO95447 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LCA5LO95447 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LCA5LO95447 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LCA5LO95447 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LCA5LO95447 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LCA5LO95447 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LCA5LO95447 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LCA5LO95447 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LCA5LO95447 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LCA5LO95447 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LCA5LO95447 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LCA5LO95447 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LCA5LO95447 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LCA5LO95447 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LCA5LO95447 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LCA5LO95447 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LCA5LO95447 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.5 ms