Protein–RNA interactions for Protein: O43303

CCP110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCP110O43303 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCP110O43303 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCP110O43303 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCP110O43303 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCP110O43303 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCP110O43303 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCP110O43303 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCP110O43303 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCP110O43303 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCP110O43303 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCP110O43303 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCP110O43303 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCP110O43303 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCP110O43303 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCP110O43303 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCP110O43303 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCP110O43303 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCP110O43303 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCP110O43303 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCP110O43303 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCP110O43303 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCP110O43303 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCP110O43303 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCP110O43303 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCP110O43303 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCP110O43303 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCP110O43303 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCP110O43303 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCP110O43303 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCP110O43303 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCP110O43303 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCP110O43303 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCP110O43303 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCP110O43303 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCP110O43303 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCP110O43303 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCP110O43303 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCP110O43303 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCP110O43303 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCP110O43303 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCP110O43303 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCP110O43303 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCP110O43303 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCP110O43303 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCP110O43303 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCP110O43303 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCP110O43303 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCP110O43303 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCP110O43303 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCP110O43303 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCP110O43303 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCP110O43303 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCP110O43303 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCP110O43303 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCP110O43303 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCP110O43303 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCP110O43303 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCP110O43303 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCP110O43303 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCP110O43303 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCP110O43303 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCP110O43303 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCP110O43303 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCP110O43303 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCP110O43303 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCP110O43303 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCP110O43303 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCP110O43303 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCP110O43303 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCP110O43303 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCP110O43303 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCP110O43303 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCP110O43303 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCP110O43303 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCP110O43303 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCP110O43303 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCP110O43303 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCP110O43303 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCP110O43303 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCP110O43303 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCP110O43303 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCP110O43303 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCP110O43303 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCP110O43303 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCP110O43303 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCP110O43303 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCP110O43303 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCP110O43303 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCP110O43303 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCP110O43303 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCP110O43303 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCP110O43303 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCP110O43303 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCP110O43303 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCP110O43303 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCP110O43303 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCP110O43303 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCP110O43303 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCP110O43303 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCP110O43303 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms