Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2C9

TLR6, Toll-like receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR6Q9Y2C9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TLR6Q9Y2C9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TLR6Q9Y2C9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TLR6Q9Y2C9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TLR6Q9Y2C9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TLR6Q9Y2C9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TLR6Q9Y2C9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TLR6Q9Y2C9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TLR6Q9Y2C9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TLR6Q9Y2C9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TLR6Q9Y2C9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TLR6Q9Y2C9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TLR6Q9Y2C9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TLR6Q9Y2C9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TLR6Q9Y2C9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TLR6Q9Y2C9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TLR6Q9Y2C9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TLR6Q9Y2C9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TLR6Q9Y2C9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TLR6Q9Y2C9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TLR6Q9Y2C9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TLR6Q9Y2C9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TLR6Q9Y2C9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TLR6Q9Y2C9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TLR6Q9Y2C9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TLR6Q9Y2C9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TLR6Q9Y2C9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TLR6Q9Y2C9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TLR6Q9Y2C9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TLR6Q9Y2C9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms