Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
TNIKQ9UKE5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
TNIKQ9UKE5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
TNIKQ9UKE5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
TNIKQ9UKE5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
TNIKQ9UKE5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
TNIKQ9UKE5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC35.91■■■■□ 3.34
TNIKQ9UKE5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
TNIKQ9UKE5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
TNIKQ9UKE5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
TNIKQ9UKE5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
TNIKQ9UKE5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
TNIKQ9UKE5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
TNIKQ9UKE5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
TNIKQ9UKE5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
TNIKQ9UKE5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
TNIKQ9UKE5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
TNIKQ9UKE5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
TNIKQ9UKE5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
TNIKQ9UKE5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
TNIKQ9UKE5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
TNIKQ9UKE5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
TNIKQ9UKE5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
TNIKQ9UKE5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
TNIKQ9UKE5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
TNIKQ9UKE5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
TNIKQ9UKE5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
TNIKQ9UKE5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
TNIKQ9UKE5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
TNIKQ9UKE5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
TNIKQ9UKE5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
TNIKQ9UKE5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
TNIKQ9UKE5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
TNIKQ9UKE5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
TNIKQ9UKE5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
TNIKQ9UKE5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
TNIKQ9UKE5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC35.89■■■■□ 3.34
TNIKQ9UKE5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
TNIKQ9UKE5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
TNIKQ9UKE5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
TNIKQ9UKE5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
TNIKQ9UKE5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
TNIKQ9UKE5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
TNIKQ9UKE5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
TNIKQ9UKE5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
TNIKQ9UKE5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
TNIKQ9UKE5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
TNIKQ9UKE5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
TNIKQ9UKE5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
TNIKQ9UKE5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
TNIKQ9UKE5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
TNIKQ9UKE5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
TNIKQ9UKE5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
TNIKQ9UKE5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
TNIKQ9UKE5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
TNIKQ9UKE5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
TNIKQ9UKE5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
TNIKQ9UKE5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
TNIKQ9UKE5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
TNIKQ9UKE5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
TNIKQ9UKE5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
TNIKQ9UKE5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
TNIKQ9UKE5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
TNIKQ9UKE5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
TNIKQ9UKE5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
TNIKQ9UKE5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC35.84■■■■□ 3.33
TNIKQ9UKE5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
TNIKQ9UKE5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
TNIKQ9UKE5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
TNIKQ9UKE5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
TNIKQ9UKE5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
TNIKQ9UKE5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
TNIKQ9UKE5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
TNIKQ9UKE5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
TNIKQ9UKE5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
TNIKQ9UKE5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
TNIKQ9UKE5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC35.83■■■■□ 3.33
TNIKQ9UKE5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
TNIKQ9UKE5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
TNIKQ9UKE5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
TNIKQ9UKE5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
TNIKQ9UKE5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
TNIKQ9UKE5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
TNIKQ9UKE5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
TNIKQ9UKE5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
TNIKQ9UKE5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
TNIKQ9UKE5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
TNIKQ9UKE5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
TNIKQ9UKE5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
TNIKQ9UKE5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC35.81■■■■□ 3.32
TNIKQ9UKE5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
TNIKQ9UKE5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
TNIKQ9UKE5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
TNIKQ9UKE5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
TNIKQ9UKE5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
TNIKQ9UKE5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
TNIKQ9UKE5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
TNIKQ9UKE5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
TNIKQ9UKE5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
TNIKQ9UKE5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms