Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG7

HPS4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS4Q9NQG7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPS4Q9NQG7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPS4Q9NQG7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPS4Q9NQG7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPS4Q9NQG7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HPS4Q9NQG7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPS4Q9NQG7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPS4Q9NQG7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPS4Q9NQG7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HPS4Q9NQG7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPS4Q9NQG7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPS4Q9NQG7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPS4Q9NQG7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPS4Q9NQG7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPS4Q9NQG7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPS4Q9NQG7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPS4Q9NQG7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPS4Q9NQG7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HPS4Q9NQG7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPS4Q9NQG7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPS4Q9NQG7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPS4Q9NQG7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPS4Q9NQG7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPS4Q9NQG7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPS4Q9NQG7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPS4Q9NQG7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPS4Q9NQG7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPS4Q9NQG7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPS4Q9NQG7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPS4Q9NQG7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPS4Q9NQG7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPS4Q9NQG7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPS4Q9NQG7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPS4Q9NQG7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPS4Q9NQG7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPS4Q9NQG7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPS4Q9NQG7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPS4Q9NQG7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS4Q9NQG7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS4Q9NQG7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS4Q9NQG7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS4Q9NQG7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS4Q9NQG7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS4Q9NQG7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS4Q9NQG7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS4Q9NQG7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS4Q9NQG7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS4Q9NQG7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS4Q9NQG7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS4Q9NQG7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS4Q9NQG7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPS4Q9NQG7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPS4Q9NQG7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPS4Q9NQG7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPS4Q9NQG7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPS4Q9NQG7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPS4Q9NQG7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPS4Q9NQG7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPS4Q9NQG7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPS4Q9NQG7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPS4Q9NQG7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPS4Q9NQG7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPS4Q9NQG7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPS4Q9NQG7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPS4Q9NQG7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPS4Q9NQG7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HPS4Q9NQG7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HPS4Q9NQG7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HPS4Q9NQG7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPS4Q9NQG7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.8 ms