Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP81

SARS2, Serine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARS2Q9NP81 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SARS2Q9NP81 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms