Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
RBM42Q9BTD8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RBM42Q9BTD8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RBM42Q9BTD8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RBM42Q9BTD8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RBM42Q9BTD8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RBM42Q9BTD8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RBM42Q9BTD8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RBM42Q9BTD8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RBM42Q9BTD8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
RBM42Q9BTD8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RBM42Q9BTD8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RBM42Q9BTD8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RBM42Q9BTD8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RBM42Q9BTD8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
RBM42Q9BTD8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
RBM42Q9BTD8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RBM42Q9BTD8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RBM42Q9BTD8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RBM42Q9BTD8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RBM42Q9BTD8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RBM42Q9BTD8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RBM42Q9BTD8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RBM42Q9BTD8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RBM42Q9BTD8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
RBM42Q9BTD8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RBM42Q9BTD8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
RBM42Q9BTD8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RBM42Q9BTD8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RBM42Q9BTD8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RBM42Q9BTD8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RBM42Q9BTD8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RBM42Q9BTD8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RBM42Q9BTD8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RBM42Q9BTD8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RBM42Q9BTD8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RBM42Q9BTD8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RBM42Q9BTD8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RBM42Q9BTD8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RBM42Q9BTD8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RBM42Q9BTD8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RBM42Q9BTD8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RBM42Q9BTD8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RBM42Q9BTD8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RBM42Q9BTD8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RBM42Q9BTD8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RBM42Q9BTD8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RBM42Q9BTD8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RBM42Q9BTD8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RBM42Q9BTD8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RBM42Q9BTD8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RBM42Q9BTD8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RBM42Q9BTD8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RBM42Q9BTD8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RBM42Q9BTD8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RBM42Q9BTD8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RBM42Q9BTD8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RBM42Q9BTD8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RBM42Q9BTD8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RBM42Q9BTD8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
RBM42Q9BTD8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RBM42Q9BTD8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RBM42Q9BTD8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RBM42Q9BTD8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RBM42Q9BTD8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RBM42Q9BTD8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RBM42Q9BTD8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RBM42Q9BTD8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RBM42Q9BTD8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RBM42Q9BTD8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RBM42Q9BTD8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RBM42Q9BTD8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RBM42Q9BTD8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RBM42Q9BTD8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RBM42Q9BTD8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RBM42Q9BTD8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RBM42Q9BTD8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RBM42Q9BTD8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RBM42Q9BTD8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RBM42Q9BTD8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RBM42Q9BTD8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RBM42Q9BTD8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RBM42Q9BTD8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
RBM42Q9BTD8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RBM42Q9BTD8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RBM42Q9BTD8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RBM42Q9BTD8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RBM42Q9BTD8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RBM42Q9BTD8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RBM42Q9BTD8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RBM42Q9BTD8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RBM42Q9BTD8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RBM42Q9BTD8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RBM42Q9BTD8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RBM42Q9BTD8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RBM42Q9BTD8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
RBM42Q9BTD8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RBM42Q9BTD8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RBM42Q9BTD8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RBM42Q9BTD8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms