Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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SAMD8Q96LT4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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SAMD8Q96LT4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SAMD8Q96LT4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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SAMD8Q96LT4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
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SAMD8Q96LT4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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SAMD8Q96LT4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SAMD8Q96LT4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SAMD8Q96LT4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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SAMD8Q96LT4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SAMD8Q96LT4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SAMD8Q96LT4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SAMD8Q96LT4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SAMD8Q96LT4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
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SAMD8Q96LT4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SAMD8Q96LT4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SAMD8Q96LT4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SAMD8Q96LT4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SAMD8Q96LT4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SAMD8Q96LT4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SAMD8Q96LT4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SAMD8Q96LT4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SAMD8Q96LT4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SAMD8Q96LT4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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