Protein–RNA interactions for Protein: Q96BT3

CENPT, Centromere protein T, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPTQ96BT3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPTQ96BT3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPTQ96BT3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPTQ96BT3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPTQ96BT3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPTQ96BT3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPTQ96BT3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPTQ96BT3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPTQ96BT3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPTQ96BT3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPTQ96BT3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPTQ96BT3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPTQ96BT3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPTQ96BT3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPTQ96BT3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPTQ96BT3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPTQ96BT3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPTQ96BT3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPTQ96BT3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPTQ96BT3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPTQ96BT3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPTQ96BT3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPTQ96BT3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPTQ96BT3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPTQ96BT3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPTQ96BT3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPTQ96BT3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPTQ96BT3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPTQ96BT3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPTQ96BT3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPTQ96BT3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPTQ96BT3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPTQ96BT3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPTQ96BT3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPTQ96BT3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPTQ96BT3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPTQ96BT3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPTQ96BT3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPTQ96BT3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPTQ96BT3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPTQ96BT3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPTQ96BT3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPTQ96BT3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPTQ96BT3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPTQ96BT3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPTQ96BT3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPTQ96BT3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms