Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC82Q8N4S0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC82Q8N4S0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC82Q8N4S0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC82Q8N4S0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC82Q8N4S0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC82Q8N4S0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC82Q8N4S0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC82Q8N4S0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC82Q8N4S0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC82Q8N4S0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC82Q8N4S0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC82Q8N4S0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC82Q8N4S0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC82Q8N4S0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC82Q8N4S0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC82Q8N4S0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC82Q8N4S0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC82Q8N4S0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC82Q8N4S0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC82Q8N4S0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC82Q8N4S0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC82Q8N4S0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC82Q8N4S0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC82Q8N4S0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC82Q8N4S0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC82Q8N4S0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC82Q8N4S0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC82Q8N4S0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC82Q8N4S0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC82Q8N4S0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC82Q8N4S0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC82Q8N4S0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC82Q8N4S0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC82Q8N4S0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC82Q8N4S0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC82Q8N4S0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC82Q8N4S0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC82Q8N4S0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC82Q8N4S0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC82Q8N4S0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC82Q8N4S0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC82Q8N4S0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC82Q8N4S0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC82Q8N4S0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC82Q8N4S0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC82Q8N4S0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC82Q8N4S0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC82Q8N4S0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC82Q8N4S0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC82Q8N4S0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC82Q8N4S0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC82Q8N4S0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC82Q8N4S0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC82Q8N4S0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC82Q8N4S0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC82Q8N4S0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC82Q8N4S0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC82Q8N4S0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC82Q8N4S0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC82Q8N4S0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC82Q8N4S0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC82Q8N4S0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC82Q8N4S0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC82Q8N4S0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC82Q8N4S0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC82Q8N4S0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC82Q8N4S0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC82Q8N4S0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC82Q8N4S0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC82Q8N4S0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC82Q8N4S0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC82Q8N4S0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC82Q8N4S0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC82Q8N4S0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC82Q8N4S0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC82Q8N4S0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms