Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN0

KRTAP25-1, Keratin-associated protein 25-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP25-1Q3LHN0 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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KRTAP25-1Q3LHN0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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KRTAP25-1Q3LHN0 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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KRTAP25-1Q3LHN0 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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KRTAP25-1Q3LHN0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP25-1Q3LHN0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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