Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V9

Putative uncharacterized protein ENSP00000334305, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3C1V9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Q3C1V9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Q3C1V9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Q3C1V9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q3C1V9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q3C1V9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q3C1V9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q3C1V9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q3C1V9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q3C1V9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q3C1V9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q3C1V9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q3C1V9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q3C1V9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Q3C1V9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q3C1V9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q3C1V9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q3C1V9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q3C1V9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q3C1V9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q3C1V9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q3C1V9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q3C1V9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q3C1V9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q3C1V9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q3C1V9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q3C1V9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q3C1V9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q3C1V9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q3C1V9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q3C1V9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q3C1V9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Q3C1V9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q3C1V9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q3C1V9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q3C1V9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q3C1V9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q3C1V9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q3C1V9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q3C1V9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q3C1V9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q3C1V9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Q3C1V9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Q3C1V9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Q3C1V9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Q3C1V9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Q3C1V9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Q3C1V9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Q3C1V9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Q3C1V9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Q3C1V9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Q3C1V9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Q3C1V9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Q3C1V9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Q3C1V9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Q3C1V9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Q3C1V9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Q3C1V9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Q3C1V9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Q3C1V9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q3C1V9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q3C1V9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q3C1V9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q3C1V9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q3C1V9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q3C1V9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q3C1V9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q3C1V9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q3C1V9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q3C1V9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q3C1V9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q3C1V9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q3C1V9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q3C1V9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q3C1V9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q3C1V9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q3C1V9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q3C1V9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q3C1V9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q3C1V9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q3C1V9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q3C1V9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q3C1V9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q3C1V9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Q3C1V9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q3C1V9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q3C1V9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q3C1V9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q3C1V9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Q3C1V9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q3C1V9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q3C1V9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q3C1V9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q3C1V9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Q3C1V9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Q3C1V9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q3C1V9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q3C1V9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Q3C1V9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Q3C1V9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.4 ms