Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SREBF2Q12772 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SREBF2Q12772 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SREBF2Q12772 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SREBF2Q12772 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SREBF2Q12772 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SREBF2Q12772 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SREBF2Q12772 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SREBF2Q12772 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SREBF2Q12772 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SREBF2Q12772 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SREBF2Q12772 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SREBF2Q12772 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SREBF2Q12772 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SREBF2Q12772 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SREBF2Q12772 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SREBF2Q12772 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SREBF2Q12772 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SREBF2Q12772 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SREBF2Q12772 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SREBF2Q12772 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SREBF2Q12772 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SREBF2Q12772 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SREBF2Q12772 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SREBF2Q12772 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SREBF2Q12772 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SREBF2Q12772 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SREBF2Q12772 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SREBF2Q12772 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SREBF2Q12772 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SREBF2Q12772 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SREBF2Q12772 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SREBF2Q12772 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SREBF2Q12772 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SREBF2Q12772 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SREBF2Q12772 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SREBF2Q12772 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SREBF2Q12772 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SREBF2Q12772 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SREBF2Q12772 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SREBF2Q12772 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SREBF2Q12772 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SREBF2Q12772 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SREBF2Q12772 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SREBF2Q12772 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SREBF2Q12772 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SREBF2Q12772 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SREBF2Q12772 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SREBF2Q12772 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SREBF2Q12772 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SREBF2Q12772 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SREBF2Q12772 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SREBF2Q12772 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SREBF2Q12772 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SREBF2Q12772 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SREBF2Q12772 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SREBF2Q12772 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SREBF2Q12772 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SREBF2Q12772 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SREBF2Q12772 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SREBF2Q12772 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SREBF2Q12772 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SREBF2Q12772 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SREBF2Q12772 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SREBF2Q12772 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SREBF2Q12772 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SREBF2Q12772 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SREBF2Q12772 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SREBF2Q12772 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SREBF2Q12772 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SREBF2Q12772 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SREBF2Q12772 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SREBF2Q12772 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SREBF2Q12772 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SREBF2Q12772 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SREBF2Q12772 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SREBF2Q12772 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SREBF2Q12772 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SREBF2Q12772 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SREBF2Q12772 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SREBF2Q12772 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SREBF2Q12772 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SREBF2Q12772 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SREBF2Q12772 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SREBF2Q12772 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SREBF2Q12772 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SREBF2Q12772 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SREBF2Q12772 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SREBF2Q12772 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SREBF2Q12772 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SREBF2Q12772 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SREBF2Q12772 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SREBF2Q12772 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SREBF2Q12772 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SREBF2Q12772 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SREBF2Q12772 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SREBF2Q12772 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SREBF2Q12772 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SREBF2Q12772 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SREBF2Q12772 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
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