Protein–RNA interactions for Protein: Q12221

PUF2, mRNA-binding protein PUF2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 1,075 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF2Q12221 CDC42YLR229C 576 nt4.32□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 ELO3YLR372W 1038 nt4.32□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 POL12YBL035C 2118 nt4.32□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 YNR061CYNR061C 660 nt4.32□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 YOR131CYOR131C 657 nt4.32□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 SFG1YOR315W 1041 nt4.32□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 SUA7YPR086W 1038 nt4.32□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 RRP15YPR143W 753 nt4.32□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 SHE3YBR130C 1278 nt4.32□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 SBE2YDR351W 2595 nt4.32□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 MDR1YGR100W 2853 nt4.32□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 GAS4YOL132W 1416 nt4.31□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 MSS2YDL107W 1056 nt4.31□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 YDR056CYDR056C 618 nt4.31□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 DPB4YDR121W 591 nt4.31□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 KXD1YGL079W 657 nt4.31□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 YGR269WYGR269W 327 nt4.31□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 YHL049CYHL049C 816 nt4.31□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 YIL021C-AYIL021C-A 270 nt4.31□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 CYC1YJR048W 330 nt4.31□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 YUH1YJR099W 711 nt4.31□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 UPS2YLR168C 693 nt4.31□□□□□ -1.72 RIP-Chip
PUF2Q12221 YBL094CYBL094C 333 nt4.31□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 AIM39YOL053W 1188 nt4.31□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 IAH1YOR126C 717 nt4.31□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 YPR027CYPR027C 834 nt4.31□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 YMR1YJR110W 2067 nt4.31□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 MDM34YGL219C 1380 nt4.3□□□□□ -1.72 RIP-Chip
PUF2Q12221 PEX29YDR479C 1665 nt4.3□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 YDL124WYDL124W 939 nt4.3□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 YGL177WYGL177W 348 nt4.3□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 tQ(UUG)CtQ(UUG)C 72 nt4.3□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 tQ(UUG)D1tQ(UUG)D1 72 nt4.3□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 tQ(UUG)D2tQ(UUG)D2 72 nt4.3□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 tQ(UUG)D3tQ(UUG)D3 72 nt4.3□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 tQ(UUG)E1tQ(UUG)E1 72 nt4.3□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 tQ(UUG)HtQ(UUG)H 72 nt4.3□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 tQ(UUG)LtQ(UUG)L 72 nt4.3□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 SPO11YHL022C 1197 nt4.3□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 CMC1YKL137W 336 nt4.3□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 YLR042CYLR042C 486 nt4.3□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 YLR271WYLR271W 825 nt4.3□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 SRL4YPL033C 846 nt4.3□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 YPL068CYPL068C 882 nt4.3□□□□□ -1.72 RIP-Chip
PUF2Q12221 KIN2YLR096W 3444 nt4.3□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 TRM44YPL030W 1704 nt4.29□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 ORC6YHR118C 1308 nt4.29□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 YDL228CYDL228C 642 nt4.29□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 DAS2YDR020C 699 nt4.29□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 PLP1YDR183W 693 nt4.29□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 LST7YGR057C 729 nt4.29□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 DAM1YGR113W 1032 nt4.29□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 EFB1YAL003W 621 nt4.29□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 YJL032WYJL032W 315 nt4.29□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 TEF4YKL081W 1239 nt4.29□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 YKL091CYKL091C 933 nt4.29□□□□□ -1.72 RIP-Chip
PUF2Q12221 NSE1YLR007W 1011 nt4.29□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 SMD3YLR147C 306 nt4.29□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 POP8YBL018C 402 nt4.29□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 YMR315WYMR315W 1050 nt4.29□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 VPS21YOR089C 633 nt4.29□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 POP4YBR257W 840 nt4.29□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 MCM2YBL023C 2607 nt4.29□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 APM3YBR288C 1452 nt4.29□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 EGT2YNL327W 3126 nt4.28□□□□□ -1.72 RIP-Chip
PUF2Q12221 ALG1YBR110W 1350 nt4.28□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 YDL186WYDL186W 834 nt4.28□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 YDR029WYDR029W 315 nt4.28□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 CPR1YDR155C 489 nt4.28□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 MRPS35YGR165W 1038 nt4.28□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 RPS4BYHR203C 786 nt4.28□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 RPS4AYJR145C 786 nt4.28□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 RDN5-1RDN5-1 121 nt4.28□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 RFU1YLR073C 603 nt4.28□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 RDN5-6RDN5-6 121 nt4.28□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 YBR013CYBR013C 390 nt4.28□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 GRX5YPL059W 453 nt4.28□□□□□ -1.72 RIP-Chip
PUF2Q12221 SET6YPL165C 1122 nt4.28□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 MSK1YNL073W 1731 nt4.28□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 FLC1YPL221W 2382 nt4.28□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 YND1YER005W 1893 nt4.28□□□□□ -1.72
PUF2Q12221 SRO9YCL037C 1305 nt4.27□□□□□ -1.73 RIP-Chip
PUF2Q12221 MDM38YOL027C 1722 nt4.27□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 GDE1YPL110C 3672 nt4.27□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 YCR024C-BYCR024C-B 267 nt4.27□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 YGR149WYGR149W 1299 nt4.27□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 RAD27YKL113C 1149 nt4.27□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 MTD1YKR080W 963 nt4.27□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 JLP1YLL057C 1239 nt4.27□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 YLR156WYLR156W 345 nt4.27□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 YLR159WYLR159W 345 nt4.27□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 YLR161WYLR161W 345 nt4.27□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 SPC2YML055W 537 nt4.27□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 YOR034C-AYOR034C-A 243 nt4.27□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 MCT1YOR221C 1083 nt4.27□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 YPR142CYPR142C 564 nt4.27□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 CNS1YBR155W 1158 nt4.27□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 NPL4YBR170C 1743 nt4.26□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 THI20YOL055C 1656 nt4.26□□□□□ -1.73
PUF2Q12221 YOL075CYOL075C 3885 nt4.26□□□□□ -1.73
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