Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC4A3P48751 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC4A3P48751 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC4A3P48751 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC4A3P48751 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC4A3P48751 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC4A3P48751 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC4A3P48751 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC4A3P48751 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC4A3P48751 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC4A3P48751 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC4A3P48751 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC4A3P48751 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC4A3P48751 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC4A3P48751 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC4A3P48751 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC4A3P48751 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC4A3P48751 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC4A3P48751 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC4A3P48751 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC4A3P48751 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC4A3P48751 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC4A3P48751 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC4A3P48751 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC4A3P48751 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC4A3P48751 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC4A3P48751 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC4A3P48751 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC4A3P48751 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC4A3P48751 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SLC4A3P48751 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SLC4A3P48751 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC4A3P48751 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC4A3P48751 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC4A3P48751 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC4A3P48751 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC4A3P48751 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC4A3P48751 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC4A3P48751 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC4A3P48751 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC4A3P48751 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC4A3P48751 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC4A3P48751 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC4A3P48751 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC4A3P48751 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC4A3P48751 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC4A3P48751 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC4A3P48751 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC4A3P48751 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC4A3P48751 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC4A3P48751 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC4A3P48751 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC4A3P48751 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC4A3P48751 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC4A3P48751 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC4A3P48751 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC4A3P48751 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC4A3P48751 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC4A3P48751 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC4A3P48751 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC4A3P48751 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC4A3P48751 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC4A3P48751 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC4A3P48751 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC4A3P48751 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC4A3P48751 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC4A3P48751 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC4A3P48751 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC4A3P48751 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC4A3P48751 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC4A3P48751 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC4A3P48751 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC4A3P48751 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC4A3P48751 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC4A3P48751 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC4A3P48751 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC4A3P48751 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC4A3P48751 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC4A3P48751 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC4A3P48751 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC4A3P48751 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC4A3P48751 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC4A3P48751 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC4A3P48751 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC4A3P48751 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC4A3P48751 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC4A3P48751 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC4A3P48751 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC4A3P48751 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC4A3P48751 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC4A3P48751 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC4A3P48751 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC4A3P48751 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC4A3P48751 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC4A3P48751 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC4A3P48751 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC4A3P48751 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC4A3P48751 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC4A3P48751 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC4A3P48751 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms