Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHKA1P46020 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHKA1P46020 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHKA1P46020 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHKA1P46020 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHKA1P46020 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHKA1P46020 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHKA1P46020 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHKA1P46020 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHKA1P46020 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHKA1P46020 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PHKA1P46020 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHKA1P46020 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHKA1P46020 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHKA1P46020 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHKA1P46020 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHKA1P46020 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHKA1P46020 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHKA1P46020 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHKA1P46020 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHKA1P46020 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHKA1P46020 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHKA1P46020 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHKA1P46020 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PHKA1P46020 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PHKA1P46020 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PHKA1P46020 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PHKA1P46020 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PHKA1P46020 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PHKA1P46020 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PHKA1P46020 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PHKA1P46020 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PHKA1P46020 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PHKA1P46020 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PHKA1P46020 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PHKA1P46020 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PHKA1P46020 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PHKA1P46020 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PHKA1P46020 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PHKA1P46020 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PHKA1P46020 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PHKA1P46020 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PHKA1P46020 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PHKA1P46020 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PHKA1P46020 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PHKA1P46020 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PHKA1P46020 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PHKA1P46020 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PHKA1P46020 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PHKA1P46020 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PHKA1P46020 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PHKA1P46020 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHKA1P46020 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHKA1P46020 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHKA1P46020 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHKA1P46020 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHKA1P46020 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PHKA1P46020 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHKA1P46020 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHKA1P46020 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHKA1P46020 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHKA1P46020 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHKA1P46020 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PHKA1P46020 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PHKA1P46020 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PHKA1P46020 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PHKA1P46020 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PHKA1P46020 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PHKA1P46020 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PHKA1P46020 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PHKA1P46020 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PHKA1P46020 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PHKA1P46020 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PHKA1P46020 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PHKA1P46020 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PHKA1P46020 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PHKA1P46020 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PHKA1P46020 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PHKA1P46020 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PHKA1P46020 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PHKA1P46020 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PHKA1P46020 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PHKA1P46020 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PHKA1P46020 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PHKA1P46020 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PHKA1P46020 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PHKA1P46020 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PHKA1P46020 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PHKA1P46020 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PHKA1P46020 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PHKA1P46020 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PHKA1P46020 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PHKA1P46020 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PHKA1P46020 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PHKA1P46020 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PHKA1P46020 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PHKA1P46020 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PHKA1P46020 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PHKA1P46020 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PHKA1P46020 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms