Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEFLP07196 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEFLP07196 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEFLP07196 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEFLP07196 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEFLP07196 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEFLP07196 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEFLP07196 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEFLP07196 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEFLP07196 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEFLP07196 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEFLP07196 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEFLP07196 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEFLP07196 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEFLP07196 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NEFLP07196 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NEFLP07196 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NEFLP07196 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NEFLP07196 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NEFLP07196 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NEFLP07196 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NEFLP07196 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NEFLP07196 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NEFLP07196 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NEFLP07196 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NEFLP07196 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NEFLP07196 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NEFLP07196 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NEFLP07196 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
NEFLP07196 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
NEFLP07196 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NEFLP07196 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NEFLP07196 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NEFLP07196 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NEFLP07196 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NEFLP07196 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NEFLP07196 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NEFLP07196 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEFLP07196 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEFLP07196 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEFLP07196 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEFLP07196 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEFLP07196 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEFLP07196 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEFLP07196 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEFLP07196 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEFLP07196 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEFLP07196 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEFLP07196 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEFLP07196 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEFLP07196 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEFLP07196 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEFLP07196 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEFLP07196 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEFLP07196 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEFLP07196 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEFLP07196 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEFLP07196 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEFLP07196 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEFLP07196 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEFLP07196 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEFLP07196 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEFLP07196 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEFLP07196 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEFLP07196 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEFLP07196 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEFLP07196 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
NEFLP07196 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEFLP07196 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEFLP07196 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEFLP07196 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEFLP07196 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
NEFLP07196 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEFLP07196 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
NEFLP07196 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEFLP07196 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEFLP07196 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEFLP07196 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEFLP07196 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEFLP07196 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEFLP07196 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEFLP07196 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEFLP07196 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEFLP07196 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEFLP07196 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEFLP07196 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEFLP07196 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEFLP07196 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEFLP07196 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEFLP07196 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEFLP07196 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
NEFLP07196 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEFLP07196 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEFLP07196 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEFLP07196 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEFLP07196 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEFLP07196 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEFLP07196 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEFLP07196 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEFLP07196 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.9 ms