Protein–RNA interactions for Protein: O15164

TRIM24, Transcription intermediary factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM24O15164 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM24O15164 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM24O15164 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM24O15164 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM24O15164 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM24O15164 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM24O15164 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM24O15164 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM24O15164 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM24O15164 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM24O15164 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM24O15164 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM24O15164 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM24O15164 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM24O15164 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM24O15164 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM24O15164 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM24O15164 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM24O15164 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM24O15164 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM24O15164 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM24O15164 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM24O15164 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM24O15164 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM24O15164 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM24O15164 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM24O15164 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM24O15164 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM24O15164 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM24O15164 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM24O15164 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM24O15164 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM24O15164 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM24O15164 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM24O15164 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM24O15164 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM24O15164 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM24O15164 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM24O15164 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM24O15164 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM24O15164 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM24O15164 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM24O15164 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM24O15164 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM24O15164 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM24O15164 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM24O15164 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM24O15164 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM24O15164 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM24O15164 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM24O15164 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM24O15164 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM24O15164 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM24O15164 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM24O15164 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM24O15164 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM24O15164 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM24O15164 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM24O15164 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM24O15164 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM24O15164 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM24O15164 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM24O15164 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM24O15164 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM24O15164 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM24O15164 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM24O15164 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM24O15164 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM24O15164 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM24O15164 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM24O15164 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM24O15164 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM24O15164 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM24O15164 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM24O15164 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM24O15164 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM24O15164 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM24O15164 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM24O15164 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM24O15164 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM24O15164 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM24O15164 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM24O15164 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM24O15164 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM24O15164 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM24O15164 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM24O15164 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM24O15164 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM24O15164 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM24O15164 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM24O15164 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM24O15164 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM24O15164 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM24O15164 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM24O15164 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM24O15164 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM24O15164 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM24O15164 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM24O15164 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM24O15164 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.8 ms