Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC78A2IDD5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC78A2IDD5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms