Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y561

LRP12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP12Q9Y561 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
LRP12Q9Y561 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
LRP12Q9Y561 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LRP12Q9Y561 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LRP12Q9Y561 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LRP12Q9Y561 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LRP12Q9Y561 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LRP12Q9Y561 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LRP12Q9Y561 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LRP12Q9Y561 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LRP12Q9Y561 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LRP12Q9Y561 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LRP12Q9Y561 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LRP12Q9Y561 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LRP12Q9Y561 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LRP12Q9Y561 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRP12Q9Y561 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRP12Q9Y561 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRP12Q9Y561 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRP12Q9Y561 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRP12Q9Y561 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRP12Q9Y561 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRP12Q9Y561 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRP12Q9Y561 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRP12Q9Y561 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRP12Q9Y561 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRP12Q9Y561 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRP12Q9Y561 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
LRP12Q9Y561 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRP12Q9Y561 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRP12Q9Y561 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRP12Q9Y561 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRP12Q9Y561 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.7 ms