Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
TNIKQ9UKE5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
TNIKQ9UKE5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
TNIKQ9UKE5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
TNIKQ9UKE5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
TNIKQ9UKE5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
TNIKQ9UKE5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
TNIKQ9UKE5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
TNIKQ9UKE5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
TNIKQ9UKE5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
TNIKQ9UKE5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC36.04■■■■□ 3.36
TNIKQ9UKE5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
TNIKQ9UKE5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
TNIKQ9UKE5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
TNIKQ9UKE5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
TNIKQ9UKE5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
TNIKQ9UKE5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
TNIKQ9UKE5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
TNIKQ9UKE5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
TNIKQ9UKE5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
TNIKQ9UKE5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
TNIKQ9UKE5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
TNIKQ9UKE5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
TNIKQ9UKE5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
TNIKQ9UKE5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC36.02■■■■□ 3.36
TNIKQ9UKE5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
TNIKQ9UKE5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
TNIKQ9UKE5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
TNIKQ9UKE5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
TNIKQ9UKE5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
TNIKQ9UKE5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
TNIKQ9UKE5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
TNIKQ9UKE5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC36.01■■■■□ 3.35
TNIKQ9UKE5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
TNIKQ9UKE5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.35
TNIKQ9UKE5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
TNIKQ9UKE5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
TNIKQ9UKE5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
TNIKQ9UKE5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
TNIKQ9UKE5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
TNIKQ9UKE5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
TNIKQ9UKE5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
TNIKQ9UKE5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
TNIKQ9UKE5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
TNIKQ9UKE5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
TNIKQ9UKE5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
TNIKQ9UKE5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
TNIKQ9UKE5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
TNIKQ9UKE5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
TNIKQ9UKE5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
TNIKQ9UKE5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
TNIKQ9UKE5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
TNIKQ9UKE5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
TNIKQ9UKE5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
TNIKQ9UKE5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
TNIKQ9UKE5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
TNIKQ9UKE5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
TNIKQ9UKE5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
TNIKQ9UKE5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
TNIKQ9UKE5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
TNIKQ9UKE5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
TNIKQ9UKE5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
TNIKQ9UKE5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
TNIKQ9UKE5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
TNIKQ9UKE5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
TNIKQ9UKE5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
TNIKQ9UKE5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
TNIKQ9UKE5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
TNIKQ9UKE5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
TNIKQ9UKE5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
TNIKQ9UKE5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
TNIKQ9UKE5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
TNIKQ9UKE5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
TNIKQ9UKE5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
TNIKQ9UKE5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
TNIKQ9UKE5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
TNIKQ9UKE5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
TNIKQ9UKE5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
TNIKQ9UKE5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
TNIKQ9UKE5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
TNIKQ9UKE5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
TNIKQ9UKE5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
TNIKQ9UKE5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
TNIKQ9UKE5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
TNIKQ9UKE5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
TNIKQ9UKE5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC35.94■■■■□ 3.34
TNIKQ9UKE5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
TNIKQ9UKE5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
TNIKQ9UKE5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
TNIKQ9UKE5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
TNIKQ9UKE5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
TNIKQ9UKE5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
TNIKQ9UKE5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
TNIKQ9UKE5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
TNIKQ9UKE5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
TNIKQ9UKE5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
TNIKQ9UKE5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
TNIKQ9UKE5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
TNIKQ9UKE5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
TNIKQ9UKE5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms