Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SCN11AQ9UI33 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SCN11AQ9UI33 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SCN11AQ9UI33 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SCN11AQ9UI33 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SCN11AQ9UI33 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SCN11AQ9UI33 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SCN11AQ9UI33 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SCN11AQ9UI33 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SCN11AQ9UI33 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SCN11AQ9UI33 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SCN11AQ9UI33 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SCN11AQ9UI33 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SCN11AQ9UI33 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SCN11AQ9UI33 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SCN11AQ9UI33 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SCN11AQ9UI33 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SCN11AQ9UI33 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SCN11AQ9UI33 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
SCN11AQ9UI33 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SCN11AQ9UI33 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SCN11AQ9UI33 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SCN11AQ9UI33 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SCN11AQ9UI33 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SCN11AQ9UI33 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SCN11AQ9UI33 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SCN11AQ9UI33 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SCN11AQ9UI33 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SCN11AQ9UI33 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SCN11AQ9UI33 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SCN11AQ9UI33 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SCN11AQ9UI33 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SCN11AQ9UI33 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SCN11AQ9UI33 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SCN11AQ9UI33 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SCN11AQ9UI33 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SCN11AQ9UI33 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SCN11AQ9UI33 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SCN11AQ9UI33 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SCN11AQ9UI33 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SCN11AQ9UI33 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SCN11AQ9UI33 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SCN11AQ9UI33 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SCN11AQ9UI33 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SCN11AQ9UI33 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SCN11AQ9UI33 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SCN11AQ9UI33 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SCN11AQ9UI33 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SCN11AQ9UI33 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SCN11AQ9UI33 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SCN11AQ9UI33 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SCN11AQ9UI33 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SCN11AQ9UI33 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SCN11AQ9UI33 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SCN11AQ9UI33 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SCN11AQ9UI33 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
SCN11AQ9UI33 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SCN11AQ9UI33 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SCN11AQ9UI33 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SCN11AQ9UI33 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SCN11AQ9UI33 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
SCN11AQ9UI33 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
SCN11AQ9UI33 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SCN11AQ9UI33 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SCN11AQ9UI33 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SCN11AQ9UI33 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SCN11AQ9UI33 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SCN11AQ9UI33 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SCN11AQ9UI33 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SCN11AQ9UI33 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SCN11AQ9UI33 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SCN11AQ9UI33 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SCN11AQ9UI33 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SCN11AQ9UI33 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SCN11AQ9UI33 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SCN11AQ9UI33 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SCN11AQ9UI33 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SCN11AQ9UI33 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SCN11AQ9UI33 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SCN11AQ9UI33 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SCN11AQ9UI33 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SCN11AQ9UI33 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SCN11AQ9UI33 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SCN11AQ9UI33 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SCN11AQ9UI33 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SCN11AQ9UI33 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SCN11AQ9UI33 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SCN11AQ9UI33 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SCN11AQ9UI33 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SCN11AQ9UI33 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SCN11AQ9UI33 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SCN11AQ9UI33 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SCN11AQ9UI33 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCN11AQ9UI33 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCN11AQ9UI33 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCN11AQ9UI33 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCN11AQ9UI33 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCN11AQ9UI33 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCN11AQ9UI33 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCN11AQ9UI33 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 195.4 ms