Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG7

HPS4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS4Q9NQG7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPS4Q9NQG7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HPS4Q9NQG7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPS4Q9NQG7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPS4Q9NQG7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms