Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8X3

LINC00574, Putative uncharacterized protein LINC00574, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00574Q9H8X3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00574Q9H8X3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00574Q9H8X3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00574Q9H8X3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00574Q9H8X3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00574Q9H8X3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00574Q9H8X3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00574Q9H8X3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00574Q9H8X3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00574Q9H8X3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00574Q9H8X3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms