Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8M2

BRD9, Bromodomain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD9Q9H8M2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRD9Q9H8M2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRD9Q9H8M2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRD9Q9H8M2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRD9Q9H8M2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRD9Q9H8M2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRD9Q9H8M2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRD9Q9H8M2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRD9Q9H8M2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRD9Q9H8M2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRD9Q9H8M2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRD9Q9H8M2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRD9Q9H8M2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRD9Q9H8M2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRD9Q9H8M2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRD9Q9H8M2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRD9Q9H8M2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRD9Q9H8M2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRD9Q9H8M2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRD9Q9H8M2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRD9Q9H8M2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRD9Q9H8M2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRD9Q9H8M2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRD9Q9H8M2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRD9Q9H8M2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRD9Q9H8M2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRD9Q9H8M2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRD9Q9H8M2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRD9Q9H8M2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRD9Q9H8M2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRD9Q9H8M2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRD9Q9H8M2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRD9Q9H8M2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRD9Q9H8M2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRD9Q9H8M2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRD9Q9H8M2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRD9Q9H8M2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BRD9Q9H8M2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRD9Q9H8M2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRD9Q9H8M2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRD9Q9H8M2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRD9Q9H8M2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRD9Q9H8M2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRD9Q9H8M2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRD9Q9H8M2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRD9Q9H8M2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRD9Q9H8M2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRD9Q9H8M2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRD9Q9H8M2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRD9Q9H8M2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BRD9Q9H8M2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRD9Q9H8M2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRD9Q9H8M2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRD9Q9H8M2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRD9Q9H8M2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRD9Q9H8M2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRD9Q9H8M2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRD9Q9H8M2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRD9Q9H8M2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRD9Q9H8M2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BRD9Q9H8M2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRD9Q9H8M2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRD9Q9H8M2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD9Q9H8M2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD9Q9H8M2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD9Q9H8M2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD9Q9H8M2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD9Q9H8M2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD9Q9H8M2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD9Q9H8M2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD9Q9H8M2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD9Q9H8M2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD9Q9H8M2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD9Q9H8M2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD9Q9H8M2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD9Q9H8M2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD9Q9H8M2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD9Q9H8M2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRD9Q9H8M2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BRD9Q9H8M2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRD9Q9H8M2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRD9Q9H8M2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRD9Q9H8M2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRD9Q9H8M2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRD9Q9H8M2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRD9Q9H8M2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRD9Q9H8M2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRD9Q9H8M2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRD9Q9H8M2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRD9Q9H8M2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRD9Q9H8M2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRD9Q9H8M2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRD9Q9H8M2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRD9Q9H8M2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRD9Q9H8M2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRD9Q9H8M2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRD9Q9H8M2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BRD9Q9H8M2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRD9Q9H8M2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRD9Q9H8M2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms