Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMIM3Q9BZL3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMIM3Q9BZL3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms