Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNHG12Q9BXW3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms