Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC106Q9BWC9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC106Q9BWC9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC106Q9BWC9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms