Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RBM42Q9BTD8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RBM42Q9BTD8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RBM42Q9BTD8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
RBM42Q9BTD8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RBM42Q9BTD8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RBM42Q9BTD8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RBM42Q9BTD8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RBM42Q9BTD8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RBM42Q9BTD8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RBM42Q9BTD8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RBM42Q9BTD8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RBM42Q9BTD8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RBM42Q9BTD8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RBM42Q9BTD8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RBM42Q9BTD8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RBM42Q9BTD8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RBM42Q9BTD8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RBM42Q9BTD8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RBM42Q9BTD8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RBM42Q9BTD8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RBM42Q9BTD8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RBM42Q9BTD8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RBM42Q9BTD8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RBM42Q9BTD8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RBM42Q9BTD8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RBM42Q9BTD8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RBM42Q9BTD8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RBM42Q9BTD8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RBM42Q9BTD8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RBM42Q9BTD8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
RBM42Q9BTD8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
RBM42Q9BTD8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RBM42Q9BTD8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RBM42Q9BTD8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RBM42Q9BTD8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RBM42Q9BTD8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RBM42Q9BTD8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RBM42Q9BTD8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RBM42Q9BTD8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RBM42Q9BTD8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RBM42Q9BTD8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RBM42Q9BTD8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RBM42Q9BTD8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
RBM42Q9BTD8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RBM42Q9BTD8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RBM42Q9BTD8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RBM42Q9BTD8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RBM42Q9BTD8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RBM42Q9BTD8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RBM42Q9BTD8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RBM42Q9BTD8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
RBM42Q9BTD8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RBM42Q9BTD8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RBM42Q9BTD8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
RBM42Q9BTD8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RBM42Q9BTD8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RBM42Q9BTD8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RBM42Q9BTD8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RBM42Q9BTD8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RBM42Q9BTD8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RBM42Q9BTD8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RBM42Q9BTD8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RBM42Q9BTD8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RBM42Q9BTD8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RBM42Q9BTD8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RBM42Q9BTD8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RBM42Q9BTD8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RBM42Q9BTD8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RBM42Q9BTD8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RBM42Q9BTD8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RBM42Q9BTD8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RBM42Q9BTD8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RBM42Q9BTD8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RBM42Q9BTD8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RBM42Q9BTD8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RBM42Q9BTD8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RBM42Q9BTD8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RBM42Q9BTD8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RBM42Q9BTD8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RBM42Q9BTD8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RBM42Q9BTD8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RBM42Q9BTD8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RBM42Q9BTD8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RBM42Q9BTD8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RBM42Q9BTD8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
RBM42Q9BTD8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RBM42Q9BTD8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RBM42Q9BTD8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RBM42Q9BTD8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RBM42Q9BTD8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RBM42Q9BTD8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RBM42Q9BTD8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RBM42Q9BTD8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RBM42Q9BTD8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
RBM42Q9BTD8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RBM42Q9BTD8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RBM42Q9BTD8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
RBM42Q9BTD8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RBM42Q9BTD8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms