Protein–RNA interactions for Protein: Q96LL4

C8orf48, Uncharacterized protein C8orf48, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf48Q96LL4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C8orf48Q96LL4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C8orf48Q96LL4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C8orf48Q96LL4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C8orf48Q96LL4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C8orf48Q96LL4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C8orf48Q96LL4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C8orf48Q96LL4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C8orf48Q96LL4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C8orf48Q96LL4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C8orf48Q96LL4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C8orf48Q96LL4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C8orf48Q96LL4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C8orf48Q96LL4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C8orf48Q96LL4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C8orf48Q96LL4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C8orf48Q96LL4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C8orf48Q96LL4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C8orf48Q96LL4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
C8orf48Q96LL4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C8orf48Q96LL4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C8orf48Q96LL4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C8orf48Q96LL4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C8orf48Q96LL4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C8orf48Q96LL4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C8orf48Q96LL4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C8orf48Q96LL4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C8orf48Q96LL4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C8orf48Q96LL4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C8orf48Q96LL4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C8orf48Q96LL4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
C8orf48Q96LL4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C8orf48Q96LL4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C8orf48Q96LL4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C8orf48Q96LL4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C8orf48Q96LL4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
C8orf48Q96LL4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C8orf48Q96LL4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C8orf48Q96LL4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C8orf48Q96LL4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C8orf48Q96LL4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C8orf48Q96LL4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C8orf48Q96LL4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C8orf48Q96LL4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C8orf48Q96LL4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C8orf48Q96LL4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C8orf48Q96LL4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C8orf48Q96LL4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
C8orf48Q96LL4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C8orf48Q96LL4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C8orf48Q96LL4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C8orf48Q96LL4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C8orf48Q96LL4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C8orf48Q96LL4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C8orf48Q96LL4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C8orf48Q96LL4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C8orf48Q96LL4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C8orf48Q96LL4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C8orf48Q96LL4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C8orf48Q96LL4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C8orf48Q96LL4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C8orf48Q96LL4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C8orf48Q96LL4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C8orf48Q96LL4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C8orf48Q96LL4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C8orf48Q96LL4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C8orf48Q96LL4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C8orf48Q96LL4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms