Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PGBD1Q96JS3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PGBD1Q96JS3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms