Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC47Q96A33 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC47Q96A33 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC47Q96A33 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC47Q96A33 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC47Q96A33 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC47Q96A33 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC47Q96A33 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC47Q96A33 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC47Q96A33 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC47Q96A33 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC47Q96A33 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC47Q96A33 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC47Q96A33 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC47Q96A33 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC47Q96A33 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC47Q96A33 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC47Q96A33 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC47Q96A33 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC47Q96A33 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC47Q96A33 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC47Q96A33 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC47Q96A33 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC47Q96A33 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC47Q96A33 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC47Q96A33 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC47Q96A33 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC47Q96A33 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC47Q96A33 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC47Q96A33 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC47Q96A33 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC47Q96A33 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC47Q96A33 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC47Q96A33 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC47Q96A33 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC47Q96A33 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC47Q96A33 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC47Q96A33 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC47Q96A33 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC47Q96A33 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC47Q96A33 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC47Q96A33 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC47Q96A33 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC47Q96A33 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC47Q96A33 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC47Q96A33 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC47Q96A33 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC47Q96A33 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC47Q96A33 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC47Q96A33 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC47Q96A33 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC47Q96A33 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
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