Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ6

PARP9, Poly [ADP-ribose] polymerase 9, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP9Q8IXQ6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PARP9Q8IXQ6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARP9Q8IXQ6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms