Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUF8

RIOX2, Ribosomal oxygenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOX2Q8IUF8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIOX2Q8IUF8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIOX2Q8IUF8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIOX2Q8IUF8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RIOX2Q8IUF8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RIOX2Q8IUF8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RIOX2Q8IUF8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RIOX2Q8IUF8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RIOX2Q8IUF8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RIOX2Q8IUF8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RIOX2Q8IUF8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RIOX2Q8IUF8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RIOX2Q8IUF8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIOX2Q8IUF8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIOX2Q8IUF8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIOX2Q8IUF8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIOX2Q8IUF8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIOX2Q8IUF8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RIOX2Q8IUF8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIOX2Q8IUF8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIOX2Q8IUF8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RIOX2Q8IUF8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RIOX2Q8IUF8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RIOX2Q8IUF8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RIOX2Q8IUF8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RIOX2Q8IUF8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RIOX2Q8IUF8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RIOX2Q8IUF8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RIOX2Q8IUF8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RIOX2Q8IUF8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RIOX2Q8IUF8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RIOX2Q8IUF8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RIOX2Q8IUF8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RIOX2Q8IUF8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RIOX2Q8IUF8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RIOX2Q8IUF8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RIOX2Q8IUF8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RIOX2Q8IUF8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RIOX2Q8IUF8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RIOX2Q8IUF8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RIOX2Q8IUF8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RIOX2Q8IUF8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RIOX2Q8IUF8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RIOX2Q8IUF8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RIOX2Q8IUF8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RIOX2Q8IUF8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RIOX2Q8IUF8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RIOX2Q8IUF8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RIOX2Q8IUF8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RIOX2Q8IUF8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RIOX2Q8IUF8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RIOX2Q8IUF8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RIOX2Q8IUF8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RIOX2Q8IUF8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RIOX2Q8IUF8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RIOX2Q8IUF8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RIOX2Q8IUF8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RIOX2Q8IUF8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RIOX2Q8IUF8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RIOX2Q8IUF8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RIOX2Q8IUF8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RIOX2Q8IUF8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RIOX2Q8IUF8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIOX2Q8IUF8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIOX2Q8IUF8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIOX2Q8IUF8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIOX2Q8IUF8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIOX2Q8IUF8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIOX2Q8IUF8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIOX2Q8IUF8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIOX2Q8IUF8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIOX2Q8IUF8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIOX2Q8IUF8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIOX2Q8IUF8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIOX2Q8IUF8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIOX2Q8IUF8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIOX2Q8IUF8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RIOX2Q8IUF8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIOX2Q8IUF8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RIOX2Q8IUF8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIOX2Q8IUF8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIOX2Q8IUF8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIOX2Q8IUF8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RIOX2Q8IUF8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RIOX2Q8IUF8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIOX2Q8IUF8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIOX2Q8IUF8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIOX2Q8IUF8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RIOX2Q8IUF8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RIOX2Q8IUF8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RIOX2Q8IUF8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RIOX2Q8IUF8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RIOX2Q8IUF8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RIOX2Q8IUF8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RIOX2Q8IUF8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms