Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TAF1CQ15572 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TAF1CQ15572 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TAF1CQ15572 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TAF1CQ15572 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TAF1CQ15572 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TAF1CQ15572 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TAF1CQ15572 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TAF1CQ15572 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TAF1CQ15572 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TAF1CQ15572 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TAF1CQ15572 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TAF1CQ15572 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TAF1CQ15572 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TAF1CQ15572 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TAF1CQ15572 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TAF1CQ15572 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TAF1CQ15572 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TAF1CQ15572 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TAF1CQ15572 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TAF1CQ15572 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TAF1CQ15572 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TAF1CQ15572 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TAF1CQ15572 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TAF1CQ15572 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TAF1CQ15572 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TAF1CQ15572 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TAF1CQ15572 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TAF1CQ15572 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TAF1CQ15572 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TAF1CQ15572 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TAF1CQ15572 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TAF1CQ15572 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TAF1CQ15572 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TAF1CQ15572 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TAF1CQ15572 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TAF1CQ15572 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TAF1CQ15572 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TAF1CQ15572 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TAF1CQ15572 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TAF1CQ15572 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TAF1CQ15572 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TAF1CQ15572 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TAF1CQ15572 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TAF1CQ15572 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TAF1CQ15572 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TAF1CQ15572 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TAF1CQ15572 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TAF1CQ15572 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TAF1CQ15572 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TAF1CQ15572 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TAF1CQ15572 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TAF1CQ15572 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TAF1CQ15572 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TAF1CQ15572 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TAF1CQ15572 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TAF1CQ15572 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TAF1CQ15572 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TAF1CQ15572 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TAF1CQ15572 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TAF1CQ15572 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TAF1CQ15572 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TAF1CQ15572 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TAF1CQ15572 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TAF1CQ15572 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TAF1CQ15572 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TAF1CQ15572 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TAF1CQ15572 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TAF1CQ15572 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TAF1CQ15572 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TAF1CQ15572 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TAF1CQ15572 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TAF1CQ15572 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TAF1CQ15572 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TAF1CQ15572 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TAF1CQ15572 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TAF1CQ15572 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TAF1CQ15572 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TAF1CQ15572 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TAF1CQ15572 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TAF1CQ15572 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TAF1CQ15572 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TAF1CQ15572 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TAF1CQ15572 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TAF1CQ15572 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TAF1CQ15572 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TAF1CQ15572 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TAF1CQ15572 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TAF1CQ15572 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TAF1CQ15572 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TAF1CQ15572 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TAF1CQ15572 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TAF1CQ15572 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TAF1CQ15572 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TAF1CQ15572 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TAF1CQ15572 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TAF1CQ15572 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TAF1CQ15572 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TAF1CQ15572 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TAF1CQ15572 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
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