Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SS18Q15532 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SS18Q15532 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SS18Q15532 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SS18Q15532 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SS18Q15532 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SS18Q15532 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SS18Q15532 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SS18Q15532 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SS18Q15532 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SS18Q15532 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SS18Q15532 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SS18Q15532 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SS18Q15532 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SS18Q15532 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SS18Q15532 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SS18Q15532 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SS18Q15532 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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SS18Q15532 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SS18Q15532 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SS18Q15532 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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SS18Q15532 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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SS18Q15532 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SS18Q15532 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SS18Q15532 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SS18Q15532 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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