Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
SHROOM2Q13796 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
SHROOM2Q13796 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
SHROOM2Q13796 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
SHROOM2Q13796 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
SHROOM2Q13796 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
SHROOM2Q13796 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
SHROOM2Q13796 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
SHROOM2Q13796 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
SHROOM2Q13796 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
SHROOM2Q13796 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
SHROOM2Q13796 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.3
SHROOM2Q13796 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
SHROOM2Q13796 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
SHROOM2Q13796 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
SHROOM2Q13796 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
SHROOM2Q13796 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
SHROOM2Q13796 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
SHROOM2Q13796 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
SHROOM2Q13796 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
SHROOM2Q13796 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
SHROOM2Q13796 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
SHROOM2Q13796 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.62■■■■□ 3.29
SHROOM2Q13796 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
SHROOM2Q13796 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
SHROOM2Q13796 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
SHROOM2Q13796 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
SHROOM2Q13796 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
SHROOM2Q13796 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
SHROOM2Q13796 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
SHROOM2Q13796 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
SHROOM2Q13796 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
SHROOM2Q13796 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
SHROOM2Q13796 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
SHROOM2Q13796 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
SHROOM2Q13796 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
SHROOM2Q13796 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
SHROOM2Q13796 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
SHROOM2Q13796 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
SHROOM2Q13796 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
SHROOM2Q13796 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
SHROOM2Q13796 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
SHROOM2Q13796 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
SHROOM2Q13796 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
SHROOM2Q13796 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
SHROOM2Q13796 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
SHROOM2Q13796 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
SHROOM2Q13796 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
SHROOM2Q13796 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
SHROOM2Q13796 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
SHROOM2Q13796 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
SHROOM2Q13796 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
SHROOM2Q13796 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
SHROOM2Q13796 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
SHROOM2Q13796 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
SHROOM2Q13796 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC35.57■■■■□ 3.29
SHROOM2Q13796 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC35.57■■■■□ 3.29
SHROOM2Q13796 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC35.57■■■■□ 3.29
SHROOM2Q13796 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
SHROOM2Q13796 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
SHROOM2Q13796 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
SHROOM2Q13796 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
SHROOM2Q13796 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
SHROOM2Q13796 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
SHROOM2Q13796 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
SHROOM2Q13796 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
SHROOM2Q13796 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
SHROOM2Q13796 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
SHROOM2Q13796 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
SHROOM2Q13796 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
SHROOM2Q13796 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
SHROOM2Q13796 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
SHROOM2Q13796 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
SHROOM2Q13796 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
SHROOM2Q13796 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC35.54■■■■□ 3.28
SHROOM2Q13796 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
SHROOM2Q13796 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
SHROOM2Q13796 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
SHROOM2Q13796 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
SHROOM2Q13796 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC35.54■■■■□ 3.28
SHROOM2Q13796 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
SHROOM2Q13796 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
SHROOM2Q13796 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
SHROOM2Q13796 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
SHROOM2Q13796 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
SHROOM2Q13796 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
SHROOM2Q13796 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
SHROOM2Q13796 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
SHROOM2Q13796 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
SHROOM2Q13796 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
SHROOM2Q13796 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
SHROOM2Q13796 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC35.52■■■■□ 3.28
SHROOM2Q13796 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
SHROOM2Q13796 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
SHROOM2Q13796 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
SHROOM2Q13796 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
SHROOM2Q13796 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
SHROOM2Q13796 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.28
SHROOM2Q13796 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
SHROOM2Q13796 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms