Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NPRL3Q12980 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NPRL3Q12980 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NPRL3Q12980 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NPRL3Q12980 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NPRL3Q12980 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NPRL3Q12980 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NPRL3Q12980 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NPRL3Q12980 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NPRL3Q12980 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NPRL3Q12980 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NPRL3Q12980 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NPRL3Q12980 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NPRL3Q12980 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NPRL3Q12980 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NPRL3Q12980 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NPRL3Q12980 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NPRL3Q12980 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NPRL3Q12980 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NPRL3Q12980 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NPRL3Q12980 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NPRL3Q12980 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NPRL3Q12980 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NPRL3Q12980 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NPRL3Q12980 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NPRL3Q12980 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NPRL3Q12980 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NPRL3Q12980 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NPRL3Q12980 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NPRL3Q12980 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NPRL3Q12980 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NPRL3Q12980 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NPRL3Q12980 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NPRL3Q12980 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NPRL3Q12980 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NPRL3Q12980 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
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