Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
GRIN2AQ12879 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
GRIN2AQ12879 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
GRIN2AQ12879 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
GRIN2AQ12879 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
GRIN2AQ12879 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
GRIN2AQ12879 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
GRIN2AQ12879 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
GRIN2AQ12879 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
GRIN2AQ12879 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
GRIN2AQ12879 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
GRIN2AQ12879 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
GRIN2AQ12879 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
GRIN2AQ12879 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
GRIN2AQ12879 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
GRIN2AQ12879 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
GRIN2AQ12879 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
GRIN2AQ12879 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
GRIN2AQ12879 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
GRIN2AQ12879 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
GRIN2AQ12879 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
GRIN2AQ12879 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
GRIN2AQ12879 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
GRIN2AQ12879 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
GRIN2AQ12879 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
GRIN2AQ12879 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
GRIN2AQ12879 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
GRIN2AQ12879 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
GRIN2AQ12879 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
GRIN2AQ12879 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
GRIN2AQ12879 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
GRIN2AQ12879 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
GRIN2AQ12879 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC36.12■■■■□ 3.37
GRIN2AQ12879 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
GRIN2AQ12879 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
GRIN2AQ12879 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
GRIN2AQ12879 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
GRIN2AQ12879 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
GRIN2AQ12879 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
GRIN2AQ12879 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
GRIN2AQ12879 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
GRIN2AQ12879 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
GRIN2AQ12879 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
GRIN2AQ12879 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
GRIN2AQ12879 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
GRIN2AQ12879 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
GRIN2AQ12879 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
GRIN2AQ12879 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
GRIN2AQ12879 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
GRIN2AQ12879 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
GRIN2AQ12879 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
GRIN2AQ12879 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
GRIN2AQ12879 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC36.09■■■■□ 3.37
GRIN2AQ12879 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
GRIN2AQ12879 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
GRIN2AQ12879 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
GRIN2AQ12879 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
GRIN2AQ12879 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
GRIN2AQ12879 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
GRIN2AQ12879 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
GRIN2AQ12879 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
GRIN2AQ12879 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC36.07■■■■□ 3.37
GRIN2AQ12879 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
GRIN2AQ12879 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
GRIN2AQ12879 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
GRIN2AQ12879 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC36.07■■■■□ 3.37
GRIN2AQ12879 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
GRIN2AQ12879 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
GRIN2AQ12879 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
GRIN2AQ12879 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
GRIN2AQ12879 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
GRIN2AQ12879 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
GRIN2AQ12879 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
GRIN2AQ12879 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
GRIN2AQ12879 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
GRIN2AQ12879 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
GRIN2AQ12879 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
GRIN2AQ12879 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
GRIN2AQ12879 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
GRIN2AQ12879 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
GRIN2AQ12879 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
GRIN2AQ12879 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
GRIN2AQ12879 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
GRIN2AQ12879 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
GRIN2AQ12879 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
GRIN2AQ12879 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
GRIN2AQ12879 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
GRIN2AQ12879 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
GRIN2AQ12879 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
GRIN2AQ12879 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
GRIN2AQ12879 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
GRIN2AQ12879 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
GRIN2AQ12879 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
GRIN2AQ12879 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
GRIN2AQ12879 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
GRIN2AQ12879 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
GRIN2AQ12879 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
GRIN2AQ12879 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
GRIN2AQ12879 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
GRIN2AQ12879 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.7 ms