Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNEQ04844 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CHRNEQ04844 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms