Protein–RNA interactions for Protein: P82673

MRPS35, 28S ribosomal protein S35, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS35P82673 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
MRPS35P82673 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MRPS35P82673 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRPS35P82673 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRPS35P82673 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRPS35P82673 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRPS35P82673 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRPS35P82673 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRPS35P82673 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRPS35P82673 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MRPS35P82673 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPS35P82673 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPS35P82673 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms