Protein–RNA interactions for Protein: P0DP09

IGKV1-13, Immunoglobulin kappa variable 1-13, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-13P0DP09 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGKV1-13P0DP09 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms