Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJB1P08034 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJB1P08034 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJB1P08034 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJB1P08034 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJB1P08034 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJB1P08034 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJB1P08034 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJB1P08034 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJB1P08034 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJB1P08034 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJB1P08034 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJB1P08034 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJB1P08034 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJB1P08034 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJB1P08034 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GJB1P08034 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJB1P08034 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GJB1P08034 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJB1P08034 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJB1P08034 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJB1P08034 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJB1P08034 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJB1P08034 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJB1P08034 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJB1P08034 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJB1P08034 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJB1P08034 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJB1P08034 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJB1P08034 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJB1P08034 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJB1P08034 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJB1P08034 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJB1P08034 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJB1P08034 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJB1P08034 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJB1P08034 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJB1P08034 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJB1P08034 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GJB1P08034 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GJB1P08034 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJB1P08034 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJB1P08034 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJB1P08034 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJB1P08034 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJB1P08034 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJB1P08034 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJB1P08034 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJB1P08034 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJB1P08034 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJB1P08034 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJB1P08034 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJB1P08034 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJB1P08034 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJB1P08034 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJB1P08034 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJB1P08034 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJB1P08034 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJB1P08034 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJB1P08034 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJB1P08034 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GJB1P08034 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJB1P08034 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJB1P08034 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GJB1P08034 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJB1P08034 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJB1P08034 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJB1P08034 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJB1P08034 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJB1P08034 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJB1P08034 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJB1P08034 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJB1P08034 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJB1P08034 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJB1P08034 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJB1P08034 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJB1P08034 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GJB1P08034 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GJB1P08034 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GJB1P08034 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GJB1P08034 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
GJB1P08034 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
GJB1P08034 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GJB1P08034 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GJB1P08034 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GJB1P08034 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GJB1P08034 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJB1P08034 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJB1P08034 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJB1P08034 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJB1P08034 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJB1P08034 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJB1P08034 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJB1P08034 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GJB1P08034 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJB1P08034 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJB1P08034 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJB1P08034 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJB1P08034 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GJB1P08034 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.1 ms