Protein–RNA interactions for Protein: O75865

TRAPPC6A, Trafficking protein particle complex subunit 6A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6AO75865 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC6AO75865 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC6AO75865 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC6AO75865 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC6AO75865 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC6AO75865 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC6AO75865 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC6AO75865 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC6AO75865 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC6AO75865 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC6AO75865 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC6AO75865 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC6AO75865 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC6AO75865 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC6AO75865 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC6AO75865 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC6AO75865 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC6AO75865 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC6AO75865 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC6AO75865 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC6AO75865 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC6AO75865 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC6AO75865 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC6AO75865 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC6AO75865 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC6AO75865 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC6AO75865 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC6AO75865 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC6AO75865 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC6AO75865 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC6AO75865 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC6AO75865 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC6AO75865 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC6AO75865 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC6AO75865 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC6AO75865 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC6AO75865 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC6AO75865 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC6AO75865 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC6AO75865 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC6AO75865 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC6AO75865 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC6AO75865 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC6AO75865 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC6AO75865 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC6AO75865 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC6AO75865 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC6AO75865 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC6AO75865 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAPPC6AO75865 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAPPC6AO75865 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAPPC6AO75865 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAPPC6AO75865 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAPPC6AO75865 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAPPC6AO75865 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAPPC6AO75865 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAPPC6AO75865 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAPPC6AO75865 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAPPC6AO75865 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAPPC6AO75865 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAPPC6AO75865 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAPPC6AO75865 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAPPC6AO75865 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAPPC6AO75865 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAPPC6AO75865 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAPPC6AO75865 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAPPC6AO75865 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAPPC6AO75865 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAPPC6AO75865 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAPPC6AO75865 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAPPC6AO75865 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAPPC6AO75865 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAPPC6AO75865 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAPPC6AO75865 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAPPC6AO75865 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAPPC6AO75865 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAPPC6AO75865 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAPPC6AO75865 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAPPC6AO75865 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAPPC6AO75865 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAPPC6AO75865 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAPPC6AO75865 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC6AO75865 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC6AO75865 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC6AO75865 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC6AO75865 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC6AO75865 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC6AO75865 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC6AO75865 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC6AO75865 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC6AO75865 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC6AO75865 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC6AO75865 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC6AO75865 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC6AO75865 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC6AO75865 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC6AO75865 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC6AO75865 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC6AO75865 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC6AO75865 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms