Protein–RNA interactions for Protein: O75339

CILP, Cartilage intermediate layer protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CILPO75339 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CILPO75339 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CILPO75339 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CILPO75339 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CILPO75339 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CILPO75339 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CILPO75339 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CILPO75339 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CILPO75339 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CILPO75339 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CILPO75339 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CILPO75339 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CILPO75339 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CILPO75339 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CILPO75339 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CILPO75339 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CILPO75339 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CILPO75339 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CILPO75339 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CILPO75339 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CILPO75339 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CILPO75339 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CILPO75339 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CILPO75339 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CILPO75339 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CILPO75339 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CILPO75339 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CILPO75339 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CILPO75339 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CILPO75339 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CILPO75339 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CILPO75339 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CILPO75339 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CILPO75339 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CILPO75339 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CILPO75339 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CILPO75339 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CILPO75339 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CILPO75339 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CILPO75339 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CILPO75339 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CILPO75339 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CILPO75339 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CILPO75339 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CILPO75339 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CILPO75339 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CILPO75339 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CILPO75339 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CILPO75339 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CILPO75339 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CILPO75339 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CILPO75339 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CILPO75339 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CILPO75339 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CILPO75339 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CILPO75339 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CILPO75339 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CILPO75339 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CILPO75339 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CILPO75339 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CILPO75339 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CILPO75339 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CILPO75339 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CILPO75339 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CILPO75339 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CILPO75339 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CILPO75339 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CILPO75339 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CILPO75339 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CILPO75339 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CILPO75339 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CILPO75339 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CILPO75339 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CILPO75339 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CILPO75339 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CILPO75339 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CILPO75339 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CILPO75339 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CILPO75339 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CILPO75339 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CILPO75339 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CILPO75339 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CILPO75339 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CILPO75339 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CILPO75339 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CILPO75339 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CILPO75339 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CILPO75339 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CILPO75339 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CILPO75339 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CILPO75339 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CILPO75339 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CILPO75339 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CILPO75339 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CILPO75339 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CILPO75339 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CILPO75339 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CILPO75339 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CILPO75339 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CILPO75339 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms