Protein–RNA interactions for Protein: O75113

N4BP1, NEDD4-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP1O75113 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
N4BP1O75113 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
N4BP1O75113 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
N4BP1O75113 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
N4BP1O75113 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
N4BP1O75113 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
N4BP1O75113 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
N4BP1O75113 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
N4BP1O75113 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
N4BP1O75113 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
N4BP1O75113 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
N4BP1O75113 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
N4BP1O75113 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
N4BP1O75113 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
N4BP1O75113 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
N4BP1O75113 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
N4BP1O75113 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
N4BP1O75113 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
N4BP1O75113 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
N4BP1O75113 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
N4BP1O75113 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
N4BP1O75113 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
N4BP1O75113 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
N4BP1O75113 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
N4BP1O75113 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
N4BP1O75113 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
N4BP1O75113 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
N4BP1O75113 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
N4BP1O75113 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
N4BP1O75113 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
N4BP1O75113 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
N4BP1O75113 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
N4BP1O75113 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
N4BP1O75113 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
N4BP1O75113 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
N4BP1O75113 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
N4BP1O75113 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
N4BP1O75113 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
N4BP1O75113 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
N4BP1O75113 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
N4BP1O75113 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
N4BP1O75113 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
N4BP1O75113 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
N4BP1O75113 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
N4BP1O75113 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
N4BP1O75113 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
N4BP1O75113 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
N4BP1O75113 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
N4BP1O75113 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
N4BP1O75113 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
N4BP1O75113 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
N4BP1O75113 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
N4BP1O75113 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
N4BP1O75113 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
N4BP1O75113 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
N4BP1O75113 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
N4BP1O75113 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
N4BP1O75113 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
N4BP1O75113 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
N4BP1O75113 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
N4BP1O75113 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
N4BP1O75113 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
N4BP1O75113 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
N4BP1O75113 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
N4BP1O75113 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
N4BP1O75113 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
N4BP1O75113 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
N4BP1O75113 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
N4BP1O75113 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
N4BP1O75113 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
N4BP1O75113 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
N4BP1O75113 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
N4BP1O75113 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
N4BP1O75113 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
N4BP1O75113 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
N4BP1O75113 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
N4BP1O75113 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
N4BP1O75113 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
N4BP1O75113 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
N4BP1O75113 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
N4BP1O75113 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
N4BP1O75113 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
N4BP1O75113 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
N4BP1O75113 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
N4BP1O75113 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
N4BP1O75113 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
N4BP1O75113 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
N4BP1O75113 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
N4BP1O75113 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
N4BP1O75113 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
N4BP1O75113 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
N4BP1O75113 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
N4BP1O75113 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
N4BP1O75113 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
N4BP1O75113 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
N4BP1O75113 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
N4BP1O75113 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
N4BP1O75113 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
N4BP1O75113 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
N4BP1O75113 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.4 ms