Protein–RNA interactions for Protein: O60506

SYNCRIP, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCRIPO60506 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNCRIPO60506 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNCRIPO60506 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNCRIPO60506 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNCRIPO60506 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNCRIPO60506 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNCRIPO60506 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNCRIPO60506 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNCRIPO60506 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNCRIPO60506 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNCRIPO60506 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNCRIPO60506 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNCRIPO60506 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNCRIPO60506 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNCRIPO60506 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNCRIPO60506 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNCRIPO60506 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNCRIPO60506 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNCRIPO60506 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNCRIPO60506 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNCRIPO60506 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNCRIPO60506 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNCRIPO60506 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNCRIPO60506 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNCRIPO60506 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNCRIPO60506 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNCRIPO60506 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNCRIPO60506 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNCRIPO60506 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNCRIPO60506 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNCRIPO60506 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNCRIPO60506 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNCRIPO60506 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNCRIPO60506 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNCRIPO60506 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNCRIPO60506 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNCRIPO60506 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNCRIPO60506 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNCRIPO60506 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNCRIPO60506 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNCRIPO60506 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNCRIPO60506 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNCRIPO60506 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNCRIPO60506 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNCRIPO60506 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNCRIPO60506 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNCRIPO60506 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNCRIPO60506 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNCRIPO60506 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNCRIPO60506 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms