Protein–RNA interactions for Protein: A5D8W1

CFAP69, Cilia- and flagella-associated protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP69A5D8W1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP69A5D8W1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP69A5D8W1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP69A5D8W1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP69A5D8W1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP69A5D8W1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP69A5D8W1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP69A5D8W1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP69A5D8W1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP69A5D8W1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP69A5D8W1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP69A5D8W1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP69A5D8W1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP69A5D8W1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP69A5D8W1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP69A5D8W1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP69A5D8W1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP69A5D8W1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP69A5D8W1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP69A5D8W1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP69A5D8W1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP69A5D8W1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP69A5D8W1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP69A5D8W1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP69A5D8W1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP69A5D8W1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP69A5D8W1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP69A5D8W1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP69A5D8W1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP69A5D8W1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP69A5D8W1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP69A5D8W1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP69A5D8W1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP69A5D8W1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP69A5D8W1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP69A5D8W1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP69A5D8W1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP69A5D8W1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP69A5D8W1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP69A5D8W1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP69A5D8W1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP69A5D8W1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP69A5D8W1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP69A5D8W1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP69A5D8W1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP69A5D8W1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP69A5D8W1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CFAP69A5D8W1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CFAP69A5D8W1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP69A5D8W1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP69A5D8W1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP69A5D8W1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP69A5D8W1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP69A5D8W1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP69A5D8W1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP69A5D8W1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP69A5D8W1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP69A5D8W1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP69A5D8W1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP69A5D8W1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP69A5D8W1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP69A5D8W1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP69A5D8W1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP69A5D8W1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP69A5D8W1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP69A5D8W1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP69A5D8W1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP69A5D8W1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP69A5D8W1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP69A5D8W1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP69A5D8W1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP69A5D8W1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP69A5D8W1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP69A5D8W1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP69A5D8W1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP69A5D8W1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP69A5D8W1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP69A5D8W1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP69A5D8W1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP69A5D8W1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP69A5D8W1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP69A5D8W1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP69A5D8W1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP69A5D8W1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP69A5D8W1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP69A5D8W1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP69A5D8W1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP69A5D8W1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP69A5D8W1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP69A5D8W1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP69A5D8W1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP69A5D8W1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP69A5D8W1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP69A5D8W1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP69A5D8W1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP69A5D8W1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP69A5D8W1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP69A5D8W1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP69A5D8W1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP69A5D8W1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 186.2 ms