Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYTH4Q9UIA0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYTH4Q9UIA0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYTH4Q9UIA0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYTH4Q9UIA0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYTH4Q9UIA0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYTH4Q9UIA0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYTH4Q9UIA0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYTH4Q9UIA0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYTH4Q9UIA0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CYTH4Q9UIA0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYTH4Q9UIA0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYTH4Q9UIA0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYTH4Q9UIA0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYTH4Q9UIA0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYTH4Q9UIA0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYTH4Q9UIA0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYTH4Q9UIA0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYTH4Q9UIA0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYTH4Q9UIA0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYTH4Q9UIA0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYTH4Q9UIA0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CYTH4Q9UIA0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYTH4Q9UIA0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYTH4Q9UIA0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYTH4Q9UIA0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYTH4Q9UIA0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYTH4Q9UIA0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CYTH4Q9UIA0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYTH4Q9UIA0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYTH4Q9UIA0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYTH4Q9UIA0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYTH4Q9UIA0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYTH4Q9UIA0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYTH4Q9UIA0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYTH4Q9UIA0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYTH4Q9UIA0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CYTH4Q9UIA0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYTH4Q9UIA0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYTH4Q9UIA0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYTH4Q9UIA0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYTH4Q9UIA0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYTH4Q9UIA0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYTH4Q9UIA0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYTH4Q9UIA0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYTH4Q9UIA0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYTH4Q9UIA0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CYTH4Q9UIA0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CYTH4Q9UIA0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYTH4Q9UIA0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYTH4Q9UIA0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYTH4Q9UIA0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYTH4Q9UIA0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYTH4Q9UIA0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYTH4Q9UIA0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYTH4Q9UIA0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYTH4Q9UIA0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYTH4Q9UIA0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYTH4Q9UIA0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYTH4Q9UIA0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYTH4Q9UIA0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYTH4Q9UIA0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYTH4Q9UIA0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CYTH4Q9UIA0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CYTH4Q9UIA0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYTH4Q9UIA0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CYTH4Q9UIA0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYTH4Q9UIA0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYTH4Q9UIA0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYTH4Q9UIA0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYTH4Q9UIA0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYTH4Q9UIA0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms